Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO47Q5MNV8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms