Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPANXN4Q5MJ08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms