Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHC1Q5JVL4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms