Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
WDR38Q5JTN6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR38Q5JTN6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR38Q5JTN6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
WDR38Q5JTN6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms