Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTH9

RRP12, RRP12-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP12Q5JTH9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP12Q5JTH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP12Q5JTH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms