Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB41Q5JT25 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB41Q5JT25 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms