Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPM1JQ5JR12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms