Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTL5Q5HYW3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTL5Q5HYW3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms