Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf116Q5BN46 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf116Q5BN46 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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