Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSP90AA4PQ58FG1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSP90AA4PQ58FG1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms