Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D3Q587I9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D3Q587I9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms