Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALFQ53S48 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALFQ53S48 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms