Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CDCA8Q53HL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDCA8Q53HL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDCA8Q53HL2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CDCA8Q53HL2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDCA8Q53HL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDCA8Q53HL2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 569.7 ms