Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GLE1Q53GS7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GLE1Q53GS7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLE1Q53GS7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms