Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC1Q4ZHG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms