Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KHDC1Q4VXA5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KHDC1Q4VXA5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KHDC1Q4VXA5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms