Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SV2CQ496J9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SV2CQ496J9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms