Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LETM2Q2VYF4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LETM2Q2VYF4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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