Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEN1Q17RS7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEN1Q17RS7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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