Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDO1Q16878 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDO1Q16878 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
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