Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPP1Q16831 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPP1Q16831 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms