Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCK2Q16822 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PCK2Q16822 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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