Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DBN1Q16643 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBN1Q16643 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms