Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGCBQ16585 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGCBQ16585 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SGCBQ16585 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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