Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGA3Q16281 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGA3Q16281 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNGA3Q16281 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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