Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F4Q16254 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F4Q16254 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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