Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTH1Q15438 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH1Q15438 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms