Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNN3Q15417 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNN3Q15417 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNN3Q15417 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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