Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TLR1Q15399 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TLR1Q15399 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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