Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PCM1Q15154 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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PCM1Q15154 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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PCM1Q15154 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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PCM1Q15154 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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PCM1Q15154 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCM1Q15154 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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