Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD6Q15008 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMD6Q15008 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMD6Q15008 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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