Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSPNQ14714 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSPNQ14714 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms