Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3AQ14563 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3AQ14563 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms