Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BECN1Q14457 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BECN1Q14457 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms