Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CIRBPQ14011 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIRBPQ14011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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