Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2H2Q13888 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2H2Q13888 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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