Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EXOSC2Q13868 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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