Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA9Q13797 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA9Q13797 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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