Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR1Q13613 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR1Q13613 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR1Q13613 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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