Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX6Q13608 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX6Q13608 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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