Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAB1Q13480 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAB1Q13480 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GAB1Q13480 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms