Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGCGQ13326 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCGQ13326 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCGQ13326 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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