Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGDRQ13258 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGDRQ13258 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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