Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF6Q13247 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF6Q13247 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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