Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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