Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECH1Q13011 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ECH1Q13011 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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