Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK3Q13003 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
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