Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK2Q13002 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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