Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-9■■■■□ 24
ILF3Q12906 TGFB1-203ENST00000598758 559 ntTSL 59.32□□□□□ -0.923e-9■■■■□ 24
ILF3Q12906 EEA1-203ENST00000547833 661 ntTSL 318.57■□□□□ 0.564e-10■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 EEA1-205ENST00000553019 558 ntTSL 518.51■□□□□ 0.554e-10■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 RAD9A-211ENST00000622583 565 ntTSL 215.12■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 EEA1-202ENST00000418984 2542 ntTSL 515.02■□□□□ -04e-10■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.784e-10■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.037e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PTCD3-208ENST00000469585 885 ntTSL 26.12□□□□□ -1.437e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PTCD3-205ENST00000464541 890 ntTSL 55.86□□□□□ -1.477e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PTCD3-211ENST00000476215 754 ntTSL 34.72□□□□□ -1.657e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 33.54□□□□□ -1.847e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PTCD3-218ENST00000493430 782 ntTSL 33.3□□□□□ -1.887e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 CCT8-204ENST00000470450 1872 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.877e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.027e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 28.17□□□□□ -1.17e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 CCT8-203ENST00000432178 556 ntTSL 23.33□□□□□ -1.887e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.612e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.82e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.412e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-204ENST00000467642 1934 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-207ENST00000477578 850 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 ZC3HC1-206ENST00000471022 978 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-206ENST00000606952 1275 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-205ENST00000497069 837 ntTSL 315.64■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.354e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.384e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 PMF1-204ENST00000466489 933 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 23.9
ILF3Q12906 NRDE2-203ENST00000554464 612 ntTSL 317.33■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 NRDE2-202ENST00000553409 3434 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 NRDE2-205ENST00000556189 2937 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.777e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.57e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 521.85■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 GRB10-221ENST00000483819 657 ntTSL 221.65■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 23.8
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ILF3Q12906 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.464e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 GRB10-220ENST00000483157 540 ntTSL 412.31□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 23.8
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ILF3Q12906 GRB10-223ENST00000492265 447 ntTSL 34.41□□□□□ -1.74e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.811e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CERS5-204ENST00000438450 945 ntTSL 218.6■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 23.8
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ILF3Q12906 AC005726.2-203ENST00000584196 2103 ntTSL 218.32■□□□□ 0.521e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 317.28■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CERS5-226ENST00000551697 2260 ntTSL 515.47■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 315.14■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-206ENST00000437187 1029 ntTSL 315.14■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CERS5-211ENST00000547787 2132 ntTSL 214.9□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-211ENST00000589036 566 ntTSL 413.99□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-209ENST00000465293 432 ntTSL 513.25□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CERS5-202ENST00000380189 2998 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-207ENST00000437369 586 ntTSL 311.41□□□□□ -0.583e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 AC005726.2-202ENST00000531839 1033 ntAPPRIS P5 TSL 211.37□□□□□ -0.591e-8■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.73e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.696e-9■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MPHOSPH9-201ENST00000302373 3097 ntTSL 1 (best)3.26□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.946e-9■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 MPHOSPH9-217ENST00000545556 3634 ntTSL 52.83□□□□□ -1.962e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.966e-9■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 211.89□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 26.87□□□□□ -1.314e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.744e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 53.64□□□□□ -1.834e-7■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 33.49□□□□□ -1.852e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.982e-6■■■■□ 23.8
ILF3Q12906 IPO7-202ENST00000527431 607 ntTSL 420.44■□□□□ 0.866e-8■■■■□ 23.8
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