Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 IDS2YJL146W 1410 nt5.57□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 ACE2YLR131C 2313 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 GAL4YPL248C 2646 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 DTD1YDL219W 453 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 FDH1YOR388C 1131 nt5.56□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 RNR1YER070W 2667 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 AHP1YLR109W 531 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 PEX29YDR479C 1665 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 SNF2YOR290C 5112 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 MSD1YPL104W 1977 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 PHO86YJL117W 936 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 RPA43YOR340C 981 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 YPL041CYPL041C 624 nt5.55□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 FAA1YOR317W 2103 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 YLR012CYLR012C 300 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 FDH2YPL275W 711 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.54□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 MSC7YHR039C 1935 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 YDL094CYDL094C 510 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 ECT1YGR007W 972 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 TEF4YKL081W 1239 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 SVF1YDR346C 1446 nt5.53□□□□□ -1.52
TY2B-BQ12491 PTM1YKL039W 1572 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 OCA2YNL056W 594 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 TDA7YNL176C 1911 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 YCF1YDR135C 4548 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 IRC25YLR021W 540 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 DSF2YBR007C 2211 nt5.52□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 NUG1YER006W 1563 nt5.51□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 TMA19YKL056C 504 nt5.51□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 YPL216WYPL216W 3309 nt5.51□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 RSC1YGR056W 2787 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 BUD14YAR014C 2130 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 PTA1YAL043C 2358 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 FLO5YHR211W 3228 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 CKS1YBR135W 453 nt5.5□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 SRP101YDR292C 1866 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 ARN2YHL047C 1863 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 Q0182Q0182 405 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 ADD66YKL206C 804 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 EIS1YMR031C 2532 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 ACK1YDL203C 1872 nt5.49□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 UPC2YDR213W 2742 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 VPS73YGL104C 1461 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 SEG2YKL105C 3399 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 TRX3YCR083W 384 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 PEX19YDL065C 1029 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 NPY1YGL067W 1155 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 GTF1YGR102C 552 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 RPN2YIL075C 2838 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 OCA5YHL029C 2040 nt5.48□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 PWR1PWR1 941 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 HRK1YOR267C 2280 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 HIM1YDR317W 1245 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 YFR035CYFR035C 345 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 PDR16YNL231C 1056 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 SHQ1YIL104C 1524 nt5.47□□□□□ -1.53
TY2B-BQ12491 JIP4YDR475C 2631 nt5.46□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YEL057CYEL057C 702 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 RPB3YIL021W 957 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 CPR6YLR216C 1116 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 VBA1YMR088C 1689 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 SIT1YEL065W 1887 nt5.45□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 MAP1YLR244C 1164 nt5.44□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 PKH1YDR490C 2301 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 RRP17YDR412W 708 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 TCB3YML072C 4638 nt5.43□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 XKS1YGR194C 1803 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 MDM1YML104C 3384 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YGL218WYGL218W 651 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 RPL15AYLR029C 615 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 APE1YKL103C 1545 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 MCX1YBR227C 1563 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 MDY2YOL111C 639 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 MRPL51YPR100W 423 nt5.42□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 IRS4YKR019C 1848 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YPP1YGR198W 2454 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 CYK3YDL117W 2658 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 NGL2YMR285C 1548 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 PAN1YIR006C 4443 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YNR063WYNR063W 1824 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 ERJ5YFR041C 888 nt5.41□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 UBX5YDR330W 1503 nt5.4□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.4□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 YAR061WYAR061W 204 nt5.4□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 PFA4YOL003C 1137 nt5.4□□□□□ -1.54
TY2B-BQ12491 OAF1YAL051W 3144 nt5.4□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 YTM1YOR272W 1383 nt5.4□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 SLI1YGR212W 1407 nt5.39□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 ZRC1YMR243C 1329 nt5.39□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 IML2YJL082W 2196 nt5.39□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 ALR2YFL050C 2577 nt5.39□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 NSA2YER126C 786 nt5.39□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 EXO1YOR033C 2109 nt5.39□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 APE2YKL157W 2859 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 SYT1YPR095C 3681 nt5.38□□□□□ -1.55
TY2B-BQ12491 THI7YLR237W 1797 nt5.38□□□□□ -1.55
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